- III тыс. до н. э. Первой столицей Египта стал Мемфис, находившийся на границе Верхнего и Нижнего Египта. Именно вокруг него образовались крупные некрополи Гиза и Саккара, известные своими пирамидами.
- 2040 г. до н. э. — X в. до н. э. В эпоху Среднего царства главным центром стали Фивы, которые сохранили свой статус до прихода ливийцев. Именно вокруг Фив возникли уникальные комплексы храмов в Луксоре и Карнаке, за что город получил от Геродота название «Стовратные Фивы».
- 1364 г. до н. э. — 1347 г. до н. э. В краткий период правления Аменхотепа IV в качестве столицы был построен новый город — Ахетатон. Однако после смерти фараона жители спешно покинули его.
- Около 1700 г. до н. э. Племена гиксосов захватили Египет и более чем на 100 лет основали столицу в дельте реки — город Аварис (XV в. до н. э.).
- 1278 г. до н. э. 1110 г. до н. э. При Рамзесе II возведена новая столица — Пер-Рамсес, но к концу XX династии город был заброшен.
- 1070 г. до н. э. Во времена XXI династии административная столица Египта располагалась в Танисе, однако реальное управление осуществлял главный жрец из Фив.
Примерно к 3600 году до нашей эры неолитические египетские общества, жившие вдоль Нила, основывали свою культуру на выращивании сельскохозяйственных культур и одомашнивании животных. Вскоре после 3600 г. до н. э. египетское общество начало расти и усложняться. В это время появилась новая и самобытная керамика, которая была связана с левантийской керамикой.Широкое использование меди стало обычным явлением в это время.Месопотамский процесс сушки на солнце самана и архитектурные принципы, включая использование арки и углубленных стен для декоративного эффекта, стали популярными в это время.
Одновременно с этими культурными достижениями начался процесс объединения обществ и городов верхнего Нила, или Верхнего Египта. В то же время общества дельты Нила, или Нижнего Египта, также прошли процесс объединения.[Войны между Верхним Египтом и Нижним Египтом происходили часто. Во время своего правления в Верхнем Египте царь Нармер победил своих врагов в дельте и объединил оба царства Верхнего и Нижнего Египта под своим единым правлением, которое продолжалось на протяжении всего Династического Египта.
Главным городом доисторического Верхнего Египта был Нехен. Божеством-покровителем была богиня Нехбет, которая изображена в виде стервятника.
На протяжении большей части древней истории Египта Фивы были административным центром Верхнего Египта. Верхний Египет был представлен высокой живой изгородью в Белой короне, а ее символами были цветущий лотос и осока. Его божество-покровитель, Нехбет, было изображено стервятником. После объединения двух царств божества-покровители Нижнего и Верхнего Египта были представлены вместе в виде Двух Дам, чтобы защитить всех древних египтян, точно так же, как две короны объединились во всех последующих династиях.
После его опустошения ассирийцами значение Египта снизилось. При Птолемеях Птолемаида Эрмиу взяла на себя роль столицы Верхнего Египта.